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电子证据在多个方面存在问题，主要包括以下几个方面：
收集与认定的问题：
收集难度：电子证据往往存储于计算机或其他电子设备中，具有易篡改、易删除的特点，使得其收集变得相对困难。
专业技术要求：电子证据的收集、审查与认定需要依赖具有电子技术和法律知识的专业人员，这使得非专业人员难以胜任相关工作。
证据原件与设备不可分：在某些情况下，电子数据的原件只能留存在产生它的设备中，一旦离开设备，其复制品可能无法作为定案依据。
法律适用问题：
法律规定不足：尽管有一些法律条文涉及电子证据，但整体而言，电子证据的适用范围、采纳条件、可采性原则等尚未得到明确规定，这在一定程度上限制了电子证据的使用。
跨境取证问题：对于跨境或异地的电子数据，其收集与认定可能存在更为复杂的问题，如法律适用冲突、数据主权等。
证明力问题：
真实性评估：电子证据的真实性、完整性以及发端人的鉴别方法等都是评估其证明力的重要因素，但在实际操作中，这些因素的判断往往存在难度。
争议与瑕疵证据：对于存在争议或瑕疵的电子证据，其认定和处理方式可能因案件的具体情况而异，缺乏统一的标准。
存证问题：
中心化存证风险：传统的存证方式如公证存证、第三方存证等可能存在中心化的问题，一旦中心遭受攻击，容易造成存证数据丢失或被篡改。
存储成本：电子数据依赖电子介质存储，为了存储安全，经常需要使用多备份等方式，加之电子介质有其使用寿命，因此存储成本较高。
这些问题都表明，电子证据在实际应用中需要综合考虑法律、技术、程序等多个方面，以确保其合法性和有效性。随着技术的发展和法律制度的完善，相信这些问题将逐渐得到解决。
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